柠檬主栽品种有十几种。
1、北京柠檬
别名香柠檬。原产我国。是与柠檬的杂交种，因其抗逆性强，树姿矮壮，容易管理，早结丰产等特点，一般的五年的柠檬树高二点一米冠幅。枝条零乱，披散，有小刺。叶片椭圆形或卵状椭圆形。果实椭圆形，品质中等。11月中旬成熟，较丰产，较耐贮藏。
2、维拉弗拉卡柠檬
原产意大利西西里岛，我国引自意大利，广东、四川、浙江等省有种植。树势较强，树姿较开张，枝梢较密；果实椭圆形，单果重140克左右，果顶部乳突明显，果色浅黄，较光滑；果肉柔软多汁；果实11月中、下旬成熟，核少，耐贮。
3、维尔拉
原产葡萄牙。树势强大，较尤力克耐冷、热及粗放管理；果实长椭圆形，乳突圆锥形，果皮较尤力克光滑，香味浓，投产较尤力克晚，但产量高，一般5年以上的生树，最高单株产量达150千克以上。其树体着生较长刺，不便管理和易刺伤果实，栽培面积较小。