深圳没有独立设置的医科大学，深圳有两所综合大学设有医学院，分别为：
深圳大学医学部：2007年12月6日深圳市政府四届八十次常务会议讨论通过深圳大学医学院筹建方案。2008年12月获教育部批准，开设临床医学专业，同年成立深圳大学医学院。2013年4月深大成立深圳大学医学部，旨在进一步整合学科资源，优化学科布局，推动医学学科发展，探索相对独立的实体性学部运作模式和机制。
中山大学中山医学院深圳校区：中山大学深圳校区，是继中山大学东南北校区和中山大学珠海校区之后的第五个校区，成立于2015年，坐落于深圳市光明新区。中山大学深圳校区将重点发展医科和工科两门学科。在医科上，除了科学研究外，深圳市政府和中山大学还将合作在深建设三所高水平的附属医院，其中，中山大学附属第七医院即将签约。而未来，3家附属医院将新增1万张病床，缓解深圳人就医压力。