1、制作工艺不同：红糖是以甘蔗为原料，经提取糖汁、清净处理后，直接煮制不经分泌的棕红色或黄褐色的糖。赤砂糖是提取了一部分糖制成白砂糖，剩下的再干燥成赤砂糖。一定意义上，赤砂糖可以看成是白砂糖生产的“副产品”。
2、外观不同：从外表看，赤砂糖晶粒较大，晶面明显，色泽有红褐、赤红、青褐、黄褐等，而红糖因为其内含杂质较多，外表看起来比较粗糙。而且传统的红糖含水量较高，也因此保质期较短，常温下一般只能放三个月。而赤砂糖大多都是出自正规的厂家生产，含水量有严格的把控，较一般手工红糖含水量低，所以保质期也较为长久。
3、成分不同：红糖要把甘蔗内的果糖、还原糖、葡萄糖、糖蜜以及维生素和矿物质微量元素等全部结晶，是一种混合物，为多元糖。由于没有经过分蜜加工，保留特有的颜色、焦香风味和多种营养成分。而赤砂糖是生产白砂糖后的副产品进行再加工生产的糖，虽然也含有部分红糖的成分，但是把多元糖分与微量元素处理掉了。所以赤砂糖的优点是甜度高、纯度高、溶化快，适合烹饪使用，但其缺点是口感差。