孔氏是殷商遗民分化出来的姓氏。
殷商部族自始祖契开始就是一个迁徙范围很广的族群。自契到成汤十四世几百年间，大的迁徙有过八次；成汤立国到盘庚迁殷都前，又迁都5次。在历次大迁徙的过程中，殷商部族的一部分人留守祖陵，或分封为诸侯，或因其它种种原因定居下来等分散于异地是客观存在的，后来分化繁衍为了其它多个姓氏。
自契以来，殷商作为一个部族，最大的一次分化是在殷商王朝亡国之后，特别是武庚禄父复国失败之后。西周灭掉殷商王朝，特别是平定“三监之乱”以后，如何处置分布区域广大，人数众多，经济发达，文化先进的殷商遗民是一个十分棘手的问题。最后采取了分化与统一监管相结合的方法。一是将“献民”，即逃避纣王迫害和与西周政治上一致的贵族，迁移到了周的腹地、文王姬昌陵墓所在地“九毕”，《逸周书·作洛解》称“俘殷献氏，迁之九毕”。